Многие варианты в геноме человека связаны с диабетом второго типа, но поскольку большинство из них не находятся в генах, кодирующих белки, неясно, как они могут вызывать заболевание. Теперь международная команда разработала ресурс, способный раскрыть влияние этих генетических вариантов.

Работа, описанная в Cell Reports, опирается на известное мнение о том, что аномалии в группах клеток поджелудочной железы, островках Лангерганса (производят и выделяют гормоны, регулирующие уровень сахара в крови), приводят к развитию диабета второго типа. К сожалению, получить образцы островков Лангерганса человека очень сложно.

Ученые из Испании, Бельгии, Италии, Швеции, Финляндии, Великобритании и США объединились, чтобы получить более 500 образцов островков у пациентов с диабетом второго типа и без него, а также извлечь данные генома и экспрессии генов из этих образцов. На основе этих данных исследователи создали то, что они назвали TIGER (для трансляционного ресурса тканевой экспрессии генотипа островков поджелудочной железы человека).

Исследование потребовало сбора и изучения огромного количества информации, что стало возможным благодаря использованию суперкомпьютерных ресурсов и новых статистических методов. Анализ TIGER показал, что определенные генетические варианты островков у пациентов с диабетом контролируют экспрессию определенных генов. На данный момент идентифицировано 32 новых гена, которые могут способствовать риску заболевания, пишет MedicalXpress.

«Мы гордимся тем, что теперь можем поделиться этим богатством данных с научным сообществом в легкодоступной форме для всех исследователей в области диабета второго типа, без необходимости в вычислительной или биоинформатической экспертизе», – говорит соавтор Лорена Алонсо из Барселонского суперкомпьютерного центра в Испании, один из разработчиков ресурса TIGER.

Напомним, ранее UfacityNews.ru писал, что противовирусное соединение блокирует проникновение SARS-CoV-2 в клетки.